转录因子结合域富集分析
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RcisTarget 可识别基因列表中过度表达的转录因子结合基序 (TFBS)。在第一步中,RcisTarget 选择在基因集中基因的转录起始位点 (TSS) 环境中明显过度表达的 DNA 基序。这是通过使用一个数据库来实现的,该数据库包含每个基序的全基因组跨物种排名。然后注释到 TF 的基序和具有高归一化富集分数 (NES) 的基序将被保留。最后,对于每个基序和基因集,RcisTarget预测候选靶基因(即基因集中排名在前沿之上的基因)。