volcano3D 软件包提供了一种用于分析三类高维数据的工具。它使探索三个组之间差异表达的基因成为可能。其主要目的是用于在三维火山图或三向极坐标图中可视化差异表达的基因。可以使用 plotly 将这些绘图转换为交互式可视化。3 向极坐标图和 3d 火山图可应用于已测量多个属性并在三个类别中比较其相对水平的任何数据。

数据可视化 差异比较分析
July 2024

nVenn： 用于渲染广义 n 维维恩图的所有区域，同时保持每个区域的面积与所包含的元素数量大致成正比。此外，欧拉图中缺失的区域会导致表示简化。该算法生成一个 n 维维恩图，并在每个区域中插入给定区域的圆圈。然后，通过动态的自校正模拟重新排列图表，其中每个设置的边界都会收缩，直到它接触到内部的圆圈。维恩图和欧拉图广泛用于实验和数据集之间关系的可视化。但是，使用现有工具表示三个以上的数据集，同时保持每个区域的比例仍然不可行。

VENN 数据可视化
July 2024

Circos 是一个用于可视化数据和信息的软件包。它以圆形布局可视化数据——这使得 Circos 成为探索对象或位置之间关系的理想选择。圆形布局具有优势还有其他原因，尤其是它具有吸引力。R中Circos 是一个先驱工具，广泛用于在 Perl 中实现的循环布局表示。它极大地增强了科学结果的可视化（特别是在基因组学领域）。因此，具有圆形布局的地块通常被命名为“circos plot”。这里 circlize 包旨在在 R 中实现 Circos。在 R 中实现的一个重要优点是 R 是一个理想的环境，可在数据分析和数据可视化之间提供无缝连接。circlize 不是为 Circos 生成配置文件的前端包装器，而是使用 R 优雅的统计和图形引擎完全以 R 风格编码。我们的目标是保持 Circos 的灵活性和可配置性，但也使该包更易于使用，并对其进行增强以支持更多类型的图形。

圈图 数据可视化
July 2024