选择性多聚腺苷酸化 （APA） 影响大多数哺乳动物基因。由于无法使用传统的RNA-seq可靠地分析APA的全基因组研究，APA的全基因组研究受到了阻碍。我们描述了“APA量化”（QAPA），这是一种从常规RNA-seq数据推断APA的方法。QAPA 比其他方法更快、更灵敏。QAPA的应用揭示了神经发生过程中离散的、时间协调的APA程序，并且由选择性剪接调控的基因与受APA调控的基因之间几乎没有重叠。对这些数据进行建模可以发现 APA 序列代码。因此，QAPA能够使用常规RNA-seq发现和表征受监管的APA程序。

选择性多聚腺苷酸化 APA
July 2024