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整合差异表达(DE)分析和基因集富集(GSE)分析

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iDEA,该方法通过整合统计建模为 scRNAseq 研究提供强大的 DE 和 GSE 分析。我们的方法建立在分层贝叶斯模型的基础上,用于DE和GSE分析的联合建模。它仅使用汇总统计作为输入,允许通过补充和配对各种现有的 DE 方法进行有效的数据建模。它依赖于高效的期望最大化算法,该算法具有内部马尔可夫链蒙特卡洛步长,可实现可扩展推理。通过集成 DE 和 GSE 分析,iDEA 可以提高 DE 分析的能力和一致性,以及与常见现有方法相比,GSE 分析的准确性。


差异表达 基因集富集 GSE
July 2024