Placeholder image

肿瘤-免疫浸润分析

contact: czheluo@gmail.com

肿瘤进展和免疫疗法的疗效受肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度的强烈影响。由于直接测量方法的局限性,计算算法通常用于从大量肿瘤转录组谱中推断免疫细胞组成。这些估计的肿瘤免疫浸润群体与肿瘤的基因组和转录组变化有关,从而提供了对肿瘤免疫相互作用的见解。然而,对大规模公共数据的此类调查仍然具有挑战性。为了降低分析复杂肿瘤-免疫相互作用的障碍。TIMER2.0 (http://timer.cistrome.org/) 不是只使用一种算法,而是使用六种最先进的算法为癌症基因组图谱 (TCGA) 或用户提供的肿瘤图谱提供更强大的免疫浸润水平估计。TIMER2.0 提供了四个模块,用于研究免疫浸润与遗传或临床特征之间的关联,以及四个模块,用于探索 TCGA 队列中与癌症相关的关联。每个模块都可以生成一个功能性热图表,使用户能够轻松同时识别多种癌症类型的重要关联。总体而言,TIMER2.0网络服务器提供了肿瘤浸润免疫细胞的全面分析和可视化功能。


肿瘤微环境 免疫浸润分析
August 2024